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科學家將發起人類蛋白質組計劃
發布時間:2011/5/23 17:17:32 瀏覽次數:5545次 來源:英諾生物

      日前,一組科學家正在積極籌備發起一個雄心勃勃的研究項目——人類蛋白質組計劃(Human Proteome Project),旨在歸類和描繪出人體內的所有蛋白質。如果能夠實現,這將是繼“人類基因組計劃”后又一宏偉壯舉。該項目預計耗資10億美元,有研究人員因此質疑組織者能否籌集到如此巨額資金及是否能夠調動起相關參與者的研究動力。4月24日出版的《自然》(Nature)雜志也就此發表了社論。
      早在20世紀90年代中期人類基因組計劃成形時,研究人員就曾考慮過人類蛋白質組計劃,但一直沒能實現。其中一個重要的原因是,蛋白質組的規模和復雜性令人望而卻步。此次項目發起人之一、人類蛋白質組組織(HUPO)前主席John Bergeron說:“過去人們認為這超過了我們的理解能力。”
      項目參與者表示,人類蛋白質組計劃現在變得可行的部分原因在于,蛋白質編碼基因的估計數量大大減少了。過去預測的數量是5萬到10萬個,而現在認為大約只有2.1萬個,這使得人類蛋白質組的規模變得更容易處理。而且項目小組計劃聚焦于每個基因產生的單個蛋白質,而不是它的許多種形式。Bergeron說:“我們將去除所有這些復雜性。”
      這一項目的目標是,揭示每種組織內的蛋白質種類、弄清每種蛋白質在細胞中的位置以及它們與哪些其它蛋白相互作用。支持者表示,這種蛋白質“目錄”對于揭示新藥靶和生物標記以追蹤疾病進程來說是無價的。項目協作者、瑞典皇家理工學院的Mathias Uhlen說:“想一想描繪生命‘積木’的重要性,那么這一代價就完全是小意思。”
      目前,已經建立了兩個初步的工作室以討論這一計劃,項目小組準備在將于今年8月舉行的人類蛋白質組組織世界大會上首次與更廣泛的蛋白質組學界進行商談。
      美國紀念斯?。瓌P特琳癌癥中心的蛋白質組學專家Paul Tempst認為,“這對人類蛋白質組組織來說是項宏大的事業,之前從沒有過。”雖然人類蛋白質組織曾進行過一些大規模的蛋白質組研究,比如人類血漿、肝臟及腦蛋白質組計劃,但是這些研究的結果顯示,不同的實驗室(甚至相同的實驗室)經常會從同樣的樣品中鑒別出非常不同的蛋白質。Tempst說:“這說明了人體中蛋白質數量眾多,如果你在不同的實驗室進行研究而沒有統一的技術標準的話,將會得到不同的結果。”
      當然,這一項目面臨諸多困難。比如合作的問題,與人類基因組計劃相比,人類蛋白質組計劃將包括更多的實驗室,不可避免地將會遇到數據分享和競爭的問題。
      另外,籌集資金也將是個大問題,尤其是在當前科學研究投資緊縮的大環境下。美國國立癌癥研究所的Sudhir Srivastava說:“這將是個艱難的‘售賣’。”他給項目組出的主意是,將研究更多地側重于癌癥等疾病方面。他說:“在上馬一個宏大項目前,你應該說明它的臨床有用性。”

 

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